O jogo começa no início da série e segue os personagens à medida que crescem, passando por arcos bem conhecidos que incluem exames de entrada e a primeira aparição de Orochimaru, por toda a aparência de Akatsuki e o transcendental Ninja Warrior.

Ao avançar neste jogo, você pode desbloquear novos personagens e melhorar os que você tem. Você também pode participar de eventos como combate de PVP, missões de clã e eventos diários, como é comum em jogos gratuitos. quase tudo isso.